原位杂交是一种重要的生物技术手段，主要利用DNA双链分子和特异性Probe分子建立原位杂交反应，当Probe分子靠近DNA双链时，Probe分子上的特异性引物将在DNA双链上的特异序列处引发双链链接，从而形成一个叫做杂交的物料，然后利用特异的标记物及检测仪器，反映其存在与否及定量内容。
原位杂交是利用
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将特异性的核酸直接定量地检测到实时荧光发射，从而将基因表达水平空间化地进行定量检测，集成了变性/杂交、杂交、多步运行三种操作模式，适用于各种原位杂交实验，是一种重要的实时定量PCR检测方法。
仪器特点：
（1）敏感性高：非特异性污染非常低，可以检测非常少量的mRNA、DNA等物质，具有很强的敏感性。
（2）灵敏度高：由于具有单一分子灵敏度，比传统的定量PCR方法更加灵敏，可以快速检测微量物质的变化情况。
（3）节省时间：与传统的PCR定量方法相比，原位杂交仪不需要建立分子生物学实验，只需在准备好的装置上放置样品和Probe，就可以节省大量的实验时间。
（4）精确度高：可以精确地测量和检测具有特异性标记或Probe物质的变化，可以更准确地定量和计算细胞内的mRNA和DNA含量，确保定量结果的准确性。
（5）高通量：在同一仪器上可以对多种不同的环境或细胞样品进行同步检测，实现大量样品、少量试验、快速实验，从而实现了高通量检测和实验效率。
原位杂交仪作为一种重要的定量PCR方法，已深受临床、医学和生物学研究领域的青睐，在基因组学、药物研发、新药筛选等领域中得到广泛应用。它不仅可以对基因表达水平进行定量检测，而且可以检测少量物质的变化情况，更能够精确地测量和计算DNA和mRNA的含量，具有非常重要的临床研究价值。
